In seguito a un incidente aereo, Blu finisce in mare, salvato e poi cresciuto dai delfini. Nei fondali stringe una forte amicizia con Flippy, ma la situazione cambia radicalmente quando la minaccia di un mostro sottomarino costringe Blu a tornare sulla terra, dove viene accolto da un capitano: insieme partono per un'avventura per salvare il mare e dare nuova luce sulle origini del ragazzo.